• Estimulador cardíaco (marcapasos)
• Epilepsia

• Embarazo: no colocación en la región abdominal
• Problemas circulatorios arteriales importantes en los miembros inferiores: evitar programas de ESNM que induzcan las contracciones tetánicas de los músculos de los miembros inferiores
• Hernias en el abdomen o en la región inguinal: no estimulación de los músculos abdominales
• Implantes metálicos (material de osteosíntesis en prótesis): no utilización de programas que pertenezcan a la categoría: corriente directa

El uso de un tratamiento por iontoforesis en pacientes que presentan un terreno alérgico conocido (asma, eccema, rinitis alérgicas) debe ser prudente; se recomienda reducir la densidad eléctrica a 0,02 mA/cm2 en la primera sesión y detener el tratamiento al cabo de dos minutos de uso para garantizar la ausencia de reacciones cutáneas anormales: enrojecimiento, prurito, eritema…